Tematyka cen transferowych staje się przedmiotem szczególnego zainteresowania organów podatkowych. Znacząco wzrosła skuteczność typowania podmiotów powiązanych, co wynika z porównania danych o ilości kontroli, które zakończyły się oszacowaniem dochodu. W 2013 roku niespełna 53% wszystkich przeprowadzonych przez urzędy skarbowe kontroli zakończyło się ujawnieniem nieprawidłowości w zakresie cen transferowych. Natomiast już w pierwszej połowie 2014 roku udział ten wyniósł aż 89%.
Trafniejsza identyfikacja podmiotów powiązanych jest m.in. rezultatem prac nowo utworzonych komórek operacyjnych. W kwietniu 2014 roku Ministerstwo Finansów powołało Zespół Zadaniowy do spraw Kontroli Podmiotów Powiązanych, który ma zajmować się zapewnieniem skutecznego i sprawnego współdziałania organów podatkowych oraz organów kontroli skarbowej w zakresie kontroli podmiotów powiązanych. We wrześniu 2014 roku w strukturze UKS w Warszawie utworzono Centrum Kompetencyjne w zakresie cen transferowych oraz optymalizacji podatkowej, którego zadaniem ma być przede wszystkim analizowanie i monitorowanie wskazanych obszarów oraz pomoc merytoryczna i koordynacja kontroli. Planowane jest także utworzenie Centrum Kompetencji ds. Cen Transferowych w Izbie Skarbowej w Łodzi.
W związku z rosnącą świadomością administracji państwowej na temat cen transferowych, wzrasta też presja na przygotowanie dobrej jakościowo dokumentacji. Powinni o tym pamiętać wszyscy przedsiębiorcy dokonujący transakcji z podmiotami powiązanymi, szczególnie jeśli ilość i wartość transakcji dokonywanych ze spółkami z grupy kapitałowej jest znacząca.